Минеральные воды Арцаха и прилегающих к нему регионов пользовались большой популярностью у больных еще со времен язычества. Об этом свидетельствует множество материалов на разных языках, хранящихся в Матенадаране.
В XIIв. выдающийся армянский врач Мхитар Гераци в книге "Утешение при лихорадках" предостерегал от произвольного употребления минеральных вод и давал рекомендации по их использованию при лечении многих заболеваний. А историк XIIIв. Степанос Орбелян, описывая природу и исторические памятники Сисиана и соседних районов, на основании рукописей Татевского монастыря приводит и данные по использованию минеральных вод местными жителями.
Особого внимания заслуживают книги по фармакологии и лечебник XIIIв. "Анализ природы человека и его недугов", а также труды Амирдавлата Амасиаци (XVв.) , где также уделяется большое внимание целительным свойствам минеральных вод этого региона. Сведения о минеральных водах Арцаха приводятся также в персидских, арабских и европейских источниках. Отрывочные научные сведения об этих зонах и описания физических свойств серных и кислых термальных вод встречаются в работах К. Грума, Г. Абиха и Э. Гофмана. Однако первые целенаправленные научные изыскания по минеральным водам Арцаха, курортологии, климатологии, бальнеологии, гидрогеологии, геологии начались лишь в середине XXв.
Минеральные воды Арцаха относятся к группе углекислых. Наиболее известны Ширландская группа минеральных вод и источник Ттуджур (Лисогор) , входящие в Ттуджур-Ширландскую гидрогеохимическую зону (Шаумяновский район) , а также группа минеральных вод, входящих в Джермаджур-Карвачарскую зону. В пределах Джермаджур-Карвачарской гидрогеохимической зоны особый интерес представляют четыре группы минеральных вод — багырсахская, верхнеджермаджурская, нижнеджермаджурская и карвачарская.
Воды всех минеральных источников Верхнего Джермаджура относятся к типу термальных углекислых, хлорид-сульфатных натрий-кальциевых вод с температурой от 21, 6 до 62 гр. С и минерализацией в пределах 4, 3-6, 7 г/л. Суммарный дебит источников превышает 2 млн л/сутки.
В водах верхнеджермаджурских и багырсахских источников количество кальция небольшое. На багырсахском участке воды насыщены эманациями радия. Воды источников Нижнего Джермаджура содержат сульфатных ионов больше, чем хлоридных. В этих источниках отмечается повышение количества щелочей, низкое содержание хлора и увеличение количества сульфатов.
Воды карвачарского участка аналогичны водам Нижнего Джермаджура, их общая минерализация достигает 3, 2-4, 4 г/л. Содержание в воде свободной углекислоты изменчиво. Дебит углекислого газа в минеральных источниках Верхнего Джермаджура составляет 772 куб. м/сутки при дебите воды 960, 8 куб. м/сутки.
Эксплуатационные запасы месторождений Верхнего и Нижнего Джермаджура были оценены и утверждены в 1964г. в количестве 825 куб. м/сутки и 180 кум. м/сутки. Эти запасы обеспечивали потребности курорта, организованного в Верхнем Джермаджуре, в полном объеме и были достаточны для перспективного развития в будущем. В целом аналогом джермаджурских минеральных вод являются знаменитые Карловы Вары и Джермук.
Воды джермаджурских источников очень эффективны при лечении заболеваний желудочно-кишечного тракта, печени и желчных путей, почек и мочевыводящих путей, нарушений обмена веществ, диабета и ожирения, заболеваний нервной системы, опорно-двигательного аппарата, сосудов, кожных и гинекологических заболеваниях и др.
Минеральные воды, обогащенные радиоактивными элементами, подразделяются на отдельные генетические группы, среди которых особое место занимают радоновые, имеющие большое терапевтическое значение. В холодных источниках Багырсахской группы минеральных вод концентрация радона достигает более 700 единиц Махе. Их радиоактивность выше, чем источников Цхалтубо и Пятигорска.
Сильно радиоактивные воды обычно выходят из разбитых разломами гранитов, сиенитов и порфиритов. Из поверхностных пород значительной радиоактивностью отличаются разрушенные породы и четвертичные отложения, залегающие над массивами и жилами кислых магматических пород, из которых и мигрируют эманации радия. На месторождении Багырсах напорные термальные минеральные воды вскрыты двумя скважинами. Вода углекислая с общей минерализацией 6, 2-6, 6 г/л, гидрокарбонатно-хлоридно-сульфатная, натриевая. Дебит воды 20 л/сек и 42 л/сек. Воды высокотермальные углекислые, хлорид-гидрокарбонатные натриевые. Аналогом багырских вод является источник Брамбах в Германии.
Тутхунская гидрогеохимическая подзона примыкает с востока к Джермаджур-Карвачарской гидрогеохимической зоне. В долине р. Тутхуп имеются многочисленные выходы углекислых минеральных вод. Почти все источники — углекислые, гидрокарбонатные кальций-натрий-магниевые, т. е. по составу близки к джермаджур-карвачарским водам.
В бассейне реки Тутхуп была вскрыта скважина с минеральной водой, отличающейся по химическому составу от других типов вод.
Минеральные и термальные воды НКР представляют исключительную ценность. Наличие значительных дебитов, разнообразие химического и газового состава, их терапевтические свойства и благоприятное географическое расположение многих месторождений являются основой для их более широкого освоения в лечебных целях и в промышленных отраслях. По химическому составу и лечебным свойствам минеральные воды Карчавара идентичны всемирно известным источникам Карловых Вар (Чехия) , Джермука (РА) , Виши (Франция) , Брамбах и Эмс (Германия) , Железноводск (Россия) и др.
Месторождения минеральных вод республики могут иметь большое практическое значение при использовании в санаторно-курортном лечении, промышленном розливе и как источник тепловой энергии. Живописная природа и разнообразие климатических зон в местах месторождений минеральных вод создают особо благоприятные условия для использования курортно-бальнеологических возможностей Арцаха.
Среди многочисленных углекислых минеральных вод чрезвычайно ценными как для организации курортов, так и промышленного розлива является месторождение Ширлан, вода которого использовалась шушинским санаторным комплексом, Ттуджур (Лисогор) , а также Джермаджур. Ценные бальнеологические свойства издавна популярных горячих углекислых минеральных вод Джермаджура послужили основанием для строительства здесь в начале 50-х гг. прошлого столетия курортного комплекса, а также завода по розливу минеральных вод. Восстановление старых и создание новых курортных комплексов потребует инвестиций и предпринимательской инициативы. При строительстве нового курортного комплекса необходимо учесть, что курорт Джермаджур был создан в верховьях р. Тартар, на высоте более 2200м над уровнем моря, где кончается лесной массив. Проектирование и строительство нового курортного комплекса необходимо осуществлять на обширных Карвачарском и Гештекском плато, расположенных ниже по течению р. Тартар, на отметках 1550-1650м.
Минеральные воды Арцаха кроме бальнеологического интереса могут иметь и прикладное значение. Режимные наблюдения могут выявить стабильные геохимические предвестники землетрясений, названные в 1993 году В. А. Игумновым и А. Э. Казаряном "геохимическим затишьем". Перед целым рядом землетрясений, включая Спитакское, отмечались изменения дебита, химического и газового состава минеральных вод.
Углекислые минеральные воды могут быть и промышленным источником для извлечения из них некоторых редких элементов и газов. В связи с этим некоторые минеральные источники Арцаха после специального исследования могут оказаться пригодными для получения углекислого газа и редких металлов.